Ученым удалось разработать алгоритмы для диагностики подтипов рака

Автор Владимир Кучеренко 13 января, 2025 16:48

Ученым удалось разработать алгоритмы для диагностики подтипов рака

Исследователи из пяти стран разработали новые алгоритмы машинного обучения, которые способны упростить молекулярное типирование опухолей в клинической практике. Эти модели позволяют классифицировать злокачественные новообразования по известным подтипам, основываясь на минимальных наборах биологических данных. Результаты работы опубликованы в журнале Cancer Cell, а созданные алгоритмы выложены в открытый доступ, что делает их доступными для использования в медицинских учреждениях по всему миру.

Современное молекулярное типирование опухолей основано на данных, представленных в Атласе ракового генома (TCGA). Эти данные помогают определить биологические процессы, протекающие в опухоли, прогнозировать течение болезни и разрабатывать индивидуальные подходы к лечению. Однако существующие методы кластеризации часто ограничены определенными датасетами и трудно применимы в клинической практике, что существенно снижает их универсальность.

Международная команда исследователей, возглавляемая Питером Лэрдом из Института Ван Андела, провела мультиомный анализ 8791 опухоли из TCGA. Образцы включали 26 анатомогистопатологических разновидностей рака и 106 известных молекулярных подтипов. Анализ проводился по пяти ключевым параметрам: мутации, числу копий генов, матричной РНК, метилированию ДНК и микроРНК. На основе полученных данных команда разработала и протестировала пять алгоритмов машинного обучения: AKLIMATE, CloudForest, SK Grid, JADBio и subSCOPE.

Каждый из алгоритмов был настроен на выявление молекулярных подтипов рака, что позволило избежать переобучения и сохранить точность диагностики. В общей сложности было создано почти 412,6 тысячи моделей-классификаторов. Из них отобрали 737 наиболее эффективных, которые теперь доступны для определения подтипов опухолей вне исходной базы данных TCGA. Эти модели контейнеризировали, чтобы обеспечить их удобное применение в клинических условиях.

Новаторские разработки открывают возможности для создания компактных систем и диагностических наборов, которые могут использоваться для генетической диагностики рака. Такие инструменты способны значительно сократить разрыв между обширной библиотекой данных TCGA и ее реальным применением в клинике. Это может ускорить диагностику и повысить точность выбора терапевтической стратегии для пациентов.

Читать нас в Дзен Новостях
Поделиться:

ВАМ МОЖЕТ БЫТЬ ИНТЕРЕСНО:

Украине грозит потеря поддержки: Зеленский не зря испугался молитвенного завтрака

Украине грозит потеря поддержки: Зеленский не зря испугался молитвенного завтрака

🕔 10:32, 11.Фев 2025

Национальный молитвенный завтрак в США вызвал серьезный скандал на Украине. Главной причиной недовольства стало отсутствие приглашения для президента Владимира Зеленского, тогда как несколько десятков депутатов Верховной рады все же приняли

Врач Малышева: россиянам грозит дефицит аминокислот из-за низкого потребления бобовых

Врач Малышева: россиянам грозит дефицит аминокислот из-за низкого потребления бобовых

🕔 11:56, 11.Фев 2025

Врач и телеведущая Елена Малышева в эфире программы «Жить здорово!» на Первом канале высказалась о серьезной ошибке в питании россиян. По ее словам, отказ от бобовых — это большая потеря

Гонка вооружений привела к усилению Китая: флот КНР стремительно обгоняет США

Гонка вооружений привела к усилению Китая: флот КНР стремительно обгоняет США

🕔 10:13, 11.Фев 2025

Китай продолжает стремительное развитие своего военно-морского флота, демонстрируя впечатляющие темпы строительства новых боевых кораблей. Недавние спутниковые снимки, опубликованные в западных аналитических центрах, показали строительство необычной подводной лодки на одной из

Может быть интересно: